换一批猪瘟病毒Shimen株侵染猪肺泡巨噬细胞与猪血管内皮细胞的转录组共表达基因分析
Transcriptome Co-expression Gene Analysis of Porcine Alveolar Macrophages and Swine Umbilical Vein Endothelial Cells after Infection with Classical Swine Fever Virus Shimen Strain
摘要猪瘟病毒(Classical swine fever,CSFV)引起的猪瘟对于全球养猪业具有广泛危害,其深层发病机制仍待阐明.该研究基于CSFV Shimen株侵染猪肺泡巨噬细胞和猪血管内皮细胞差异表达的转录组学数据,深度挖掘这两种宿主细胞共同应答CSFV Shimen株侵染的关键基因.结果显示,真核生物起始因子4A3(eukaryotic translation initiation factor 4A3,EIF4A3)、蛋白酶体β亚基3型(proteasome subunit beta 3,PSMB3)等关键基因的异常表达可能影响宿主细胞的凋亡、周期调控等生理进程.GO(Gene Ontology)和KEGG分析表明,CSFV Shimen的侵染造成NF-κB等相关调控的生物学过程改变,并且DNA复制等信号通路出现显著性应答.联合组学分析很好地提示了CSFV Shimen对巨噬细胞及血管内皮细胞可能的共性损害,为更好地开展CSFV与宿主细胞的互作机制研究提供了有价值的信息.
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