换一批2019年-2020年北京市部分地区猪圆环病毒2型分子流行病学调查分析
Molecular Epidemiological Investigation of Porcine Circovirus Type 2 in Some Areas of Beijing from 2019 to 2020
摘要为了解北京市种猪群中猪圆环病毒2型(PCV2)的分子流行病学及遗传变异情况,采用荧光PCR方法对2019年-2020年采集自北京市4个区的种猪场7030份抗凝血进行了PCV2病原学检测,并对9份PCV2阳性样本进行了全基因组扩增、克隆与序列测定,应用DNAStar分析软件对所测定的9个毒株与国内外参考毒株的全基因组和ORF2序列进行了分析比对.结果表明,PCV2感染的总阳性率为21.41％,2019年-2020年阳性率分别为17.58％和23.78％,呈逐年上升趋势;共测得9株PCV2全基因组序列,其中2株基因组全长为1766 bp,6株为1767 bp,1株为1768 bp;9个PCV2毒株之间全基因组序列的核苷酸同源性为94.0％～99.9％,与已发表的国内外参考毒株之间的核苷酸同源性为90.4％～99.4％;9个PCV2分属于PCV2 a、PCV2 b和PCV2 d 3个基因亚型,其中有3株属于PCV2 a亚型,5株属于PCV2 b亚型,1株属于PCV2 d亚型;9个PCV2毒株ORF2编码的Cap蛋白共存在36处氨基酸变异位点,每个PCV2亚型都有其特异的氨基酸变异位点.说明PCV2在北京市的种猪群中具有较高的感染率,以PCV2 a、PCV2 b和PCV2 d这3个基因亚型共存为主,PCV2 a和PCV2 b为优势基因型.
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