猪ISG20基因生物信息学分析及其抗PEDV感染的初步研究

Bioinformatics Analysis of Porcine ISG 20 Gene and Preliminary Research of Its Effect against PEDV Infection

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摘要为了研究猪干扰素刺激基因20(interferon-stimulated gene 20,ISG20)的序列信息及其表达情况,并探讨其对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)增殖的影响,以提取的猪小肠上皮细胞IPEC-J2总RNA为模板扩增猪ISG20基因的CDS区序列,并应用生物信息学进行分析,进而构建pcDNA3.1-3×Flag-ISG20重组质粒转染入IPEC-J2细胞鉴定表达情况.此外,在转染重组质粒的细胞中感染PEDV分析ISG20对PEDV增殖的影响.结果表明,猪ISG20基因CDS区的大小为516 bp,编码171个氨基酸,理论等电点(pI)为8.84;猪ISG20存在2个N-糖基化位点和23个磷酸化位点,主要定位于细胞骨架和细胞质中,以α-螺旋和无规则卷曲构成;构建的pcDNA3.1-3 × Flag-ISG20重组质粒能够在IPEC-J2细胞中表达,蛋白大小约为19.6 ku,而且可以明显抑制PEDV的增殖;克隆了猪ISG20基因,并且在IPEC-J2细胞中重组质粒pcDNA3.1-3×Flag-ISG20能够表达且发挥抑制PEDV增殖的作用,研究结果为深入探讨PEDV与ISG20的相互作用,以及以此为靶点筛选抗PEDV生物制剂提供了思路.

作者王梦璐 ^[1] 张志杰 ^[2] 李之晗 ^[2] 聂晶晶 ^[3] 瞿云芝 ^[3] 张春红 ^[3] 刘志成 ^[3] 沈海燕 ^[3] 张建峰 ^[3] 孙亚妮 ^[4] 李玉谷 ^[5] 学术成果认领

作者单位华南农业大学兽医学院,广东广州 510642;广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室,广东广州 510640 ^[1] 西北农林科技大学动物医学院,陕西杨陵 712100;广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室,广东广州 510640 ^[2] 广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室,广东广州 510640;岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心,广东茂名 525032 ^[3] 西北农林科技大学动物医学院,陕西杨陵 712100 ^[4] 华南农业大学兽医学院,广东广州 510642 ^[5]

关键词干扰素刺激基因20 生物信息学分析真核表达猪流行性腹泻病毒 ISG20 bioinformatics analysis eukaryotic expression Porcine epidemic diarrhea virus

分类号 S852.651 S858.28

栏目名称 研究论文

DOI 10.3969/j.issn.1007-5038.2024.10.002

发布时间 2024-10-23

基金项目

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