换一批云南微小扇头蜱及镰形扇头蜱核糖体及线粒体基因多态性分析
Polymorphism Analyses of Ribosomal and Mitochondrial Genes of Rhipicephalus microplus and Rhipicephalus haemaphysaloides from Yunnan Province
摘要了解云南地区分布的微小扇头蜱(Rhipicephalus m icroplus)与镰形扇头蜱(Rhipicephalus haemaphysaloides)核糖体内转录间隔区1和2(ITS-1,ITS-2)、线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基1(cox1)及烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基4(nad4)基因序列多态性,探究核糖体及线粒体基因作为微小扇头蜱、镰形扇头蜱分子标记的应用能力.采集牛体表寄生蜱,经鉴定为微小扇头蜱与镰形扇头蜱.通过PCR分别扩增其核糖体ITS-1、ITS-2基因,线粒体cox1、nad4基因.对阳性扩增产物测序后进行拼接,利用Clustal X(1.83)做多序列比对.基于Mr Bayes 3.11使用贝叶斯(BI)法针对cox1和nad4基因构建进化树,分析其分类地位.通过比对,分析这些基因的种类序列差异和种间差异.通过对序列的碱基含量计算发现,ITS-1、ITS-2基因的G+C含量较高,cox1、nad4基因序列的G+C含量较低.微小扇头蜱4个基因的种内差异依次为ITS-1＞cox1＞nad4＞ITS-2;镰形扇头蜱种内差异依次为ITS-1＞ITS-2、cox1＞nad4.2种扇头蜱4个基因的种间差异比较为ITS-1＞nad4＞cox1＞ITS-2.微小扇头蜱与镰形扇头蜱的4个基因中ITS-1基因的种内差异变异程度最大,是用于遗传多样性的理想分子标记.2种扇头蜱的种间差异对比证实ITS-2基因的种间差异变异程度最小,适于研究2种蜱间的保守性.
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关键词
扇头蜱核糖体线粒体序列多态性分析系统发育关系分子遗传标记RhipicephalusRibosomeMitochondrionSequence polymorphism analysisPhylogenetic rela-tionshipMolecular genetic marker
分类号
S852.746
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1007-5038.2025.02.012
发布时间
2025-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
云南省家畜疫病病原生物学重点实验室项目（202449CE340019）
云南省国际科技特派员项目（202403AK140020）
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