换一批摘要为了解陕西源山羊星状病毒(Caprine astrovirus)遗传变异情况和重组现象,该研究利用RT-PCR技术对山羊腹泻粪便样品进行检测,设计8对特异性引物,对检测阳性的山羊星状病毒进行全基因组扩增,并使用DNAStar软件、MEGA11.0软件、RDP4软件和Simplot软件对扩增到的山羊星状病毒全基因组序列进行分析.结果显示,成功扩增到山羊星状病毒(命名为SX-1/2023)全基因组序列;SX-1/2023全基因组核苷酸同源性和ORF2基因氨基酸同源性与中国西南地区的SWUN/LJK2-2/2020株最高;系统发育树显示SX-1/2023与其他 MAstV-24处于同一分支,属于MAstV-24;重组事件预测显示,SX-1/2023未发生重组事件,但作为主要亲本毒株参与了 SWUN/LJK2-2/2020株的重组事件.该研究为山羊星状病毒的流行病学调查及实验室诊断技术开发提供了基础数据.
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关键词
山羊星状病毒全基因组测序遗传进化分析基因重组分析Caprine astrovirusWhole genome sequencingGenetic evolution analysisGene recombination analysis
分类号
S852.654
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1007-5038.2025.09.007
发布时间
2025-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家重点研发计划（2021YFD1600704）；
省级农业专项资金项目（XNDY2210）
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