换一批云南某猪场猪星状病毒4型全基因克隆与序列分析
Determination and Whole Gene Sequence Analysis of Porcine Astrovirus Type 4 Yunnan Strain
摘要为获取云南猪星状病毒4型(PAstV4)阳性样品全基因组序列并分析其遗传特征.对云南地区猪样品进行PAstV4型检测,在此基础上定向设计7对测序引物扩增拼接出PAstV4型云南株(YN01)全基因组序列,进行序列比对并构建系统发生树.基因序列分析结果显示:YN01株基因组全长6 725 bp,进化树和同源性分析,YN01株与PAstV4在同一分支.全基因核苷酸同源性在74.5％～86％之间,其中与SJZ株同源性最高为86％,与PAstV其他四型的同源性仅为40.9％～49％.ORF2基因编码衣壳蛋白,其核苷酸及编码的氨基酸序列区域差异性较大,1～450 aa较为保守,450～890 aa为高突变区域,YN01在504～1 354 nt处与CH株发生重组的现象.YN01株同源性差异提示PAstV不同型间存在较大差异,且重组现象提升该病毒或通过衣壳蛋白突变和重组进行适应进化,全基因组序列扩增为云南地区PAstV起源、进化、遗传多样性及防制提供了科学基础.
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关键词
猪星状病毒全基因组序列遗传进化分析重组Percine AstrovirusWhole genome sequenceGenetic evolution analysisRecombination
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1007-5038.2026.01.004
发布时间
2026-03-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
云南省教育厅科学研究基金项目（2023J1636）
云南省科协农民院士科技服务站项目
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