云南部分地区羊芽囊原虫感染情况调查及亚型鉴定
Infection Investigation and Subtype Identification of Blastocystis sp.in Partial Areas of Yunnan Province
摘要为了解云南省绵羊和山羊芽囊原虫(Blastocystis)的感染情况和基因分型分布,于2023年7月至2024年1月从昆明市、红河州、楚雄州采集绵羊和山羊粪样,提取粪便基因组DNA,基于芽囊原虫小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因进行PCR扩增,将阳性样本测序后,在NCBI上进行BLAST比对分析,鉴定虫种和基因亚型.使用MEGA 11.0软件以邻接法(NJ)构建系统进化树,使用SPSS 20.0软件利用 x2检验对羊芽囊原虫检出率影响因素进行统计学分析.共采集138份羊粪样,其中35份(25.36%)粪样扩增出芽囊原虫SSU rRNA基因片段.昆明市、楚雄州、红河州的检出率分别为30.00%、24.07%和16.67%;奶山羊、黑山羊、绵羊的检出率分别为30.00%、24.14%和15.00%.不同地区、品种、养殖模式间检出率差异不显著.序列比对分析显示,云南省三个地区检出的芽囊原虫基因亚型有ST1、ST10和ST14,3份阳性样品鉴定为ST1亚型,9份阳性样品鉴定为ST14亚型,23份阳性样品鉴定为ST10亚型,ST10亚型为优势亚型(23/35).进化分析显示,获得的ST1、ST10和ST14样品数据均与其代表的基因型参考序列聚在一支,拓扑结构与之前的研究结果一致.结果表明,云南省三个地区的绵羊和山羊芽囊原虫感染普遍,优势基因亚型为ST10,且存在人兽共患基因亚型ST1,提示有芽囊原虫人兽共患风险,为后续公共卫生监测及芽囊原虫病的进一步研究提供数据支持.
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