基于不同背膘厚的秦川牛瘤胃发酵性能与微生物组成及功能分析
Analysis of Rumen Fermentation Performance and Microbial Composition and Function of Qinchuan Cattle Based on Different Backfat Thickness
摘要本试验旨在研究不同背膘厚的秦川牛瘤胃的发酵性能与微生物组成及功能的差异.选取114头健康成年秦川母牛,测定背膘厚,从中筛选高背膘(H-BFT组)和低背膘(L-BFT组)秦川牛各15头,收集瘤胃液样品用于瘤胃发酵指标测定和瘤胃微生物16S rRNA测序.结果表明:1)H-BFT组的瘤胃乙酸、丁酸、总挥发性脂肪酸浓度及乙酸/丙酸均显著高于L-BFT组(P<0.05).2)H-BFT组的瘤胃微生物ACE指数和PD whole-tree指数均显著高于L-BFT组(P<0.05).H-BFT组和L-BFT组的瘤胃微生物群落没有明显区分开,有较高的微生物群落相似度.3)2组瘤胃优势菌门为拟杆菌门(Bacteroidota)和厚壁菌门(Firmicutes),优势菌属为普雷沃氏菌属(Prevotella)和理研菌科 RC9 肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group).在门水平上,H-BFT组的瘤胃迷踪菌门(Elusimicrobiota)和纤维杆菌门(Fibrobacterota)相对丰度显著高于L-BFT组(P<0.05);在属水平上,H-BFT组的瘤胃迷踪菌属(Elusimicrobium)、丁酸弧菌属(Butyrivibrio)、纤维杆菌属(Fibrobacter)、密螺旋体属(Treponema)相对丰度显著高于L-BFT组(P<0.05),而瘤胃Prevotella和琥珀酸菌属(Succiniclasticum)相对丰度显著低于L-BFT组(P<0.05).4)KEGG功能分析表明,H-BFT组的瘤胃微生物在糖的生物合成与代谢和脂质代谢等过程中显著富集(P<0.05),而L-BFT组的瘤胃微生物在氨基酸代谢和其他次生代谢产物的生物合成等过程中显著富集(P<0.05).5)共现网络分析表明,H-BFT组的瘤胃微生物共现网络的边、聚类系数和平均度均明显高于L-BFT组,而共现网络的正向连接和模块化程度则明显低于L-BFT组.克里斯滕森菌科 R-7 群(Christensenellaceae_R-7_group)和毛螺菌科 UCG-006(Lachnospiraceae_UCG-006)分别是H-BFT组和L-BFT组的核心网络节点.6)相关性分析表明,背膘厚与总挥发性脂肪酸、乙酸、丁酸浓度和乙酸/丙酸及Butyrivibrio和Elusimicrobium相对丰度呈显著正相关(P<0.05),而与普雷沃氏菌科 UCG-001(Prevotellaceae_UCG-001)和 Prevotella 相对丰度呈显著负相关(P<0.05).由此可见,背膘厚的差异与秦川牛瘤胃发酵性能、微生物多样性及功能特征密切相关.H-BFT组表现出更高的瘤胃微生物多样性、更复杂的微生物共现网络以及显著富集的糖类和脂质代谢功能,提示瘤胃微生物可能通过调控代谢途径参与背膘的形成.
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