换一批
换一批摘要目的比较和挖掘葡萄胎、绒毛膜癌基因表达谱数据,筛选与绒毛膜癌恶性演进相关的新基因.方法分别以葡萄胎、绒毛膜癌为检测组,均以正常胎盘绒毛为对照组,在对两组各3例葡萄胎、绒毛膜癌进行基因芯片检测的基础上,对其共表达基因表达谱数据进行分层聚类分析,找到有相似表达趋势的候选基因,应用生物信息学方法,进行电子Northern分析及基因结构功能初步分析,用半定量RT-PCR技术对3个筛选基因进行初步鉴定.结果在所有3例绒毛膜癌基因表达数据中找到共表达候选基因52条,经聚类分析初步筛选出绒毛膜癌相关基因19条,主要包括dynamin(L07807),zincfinger protein ZNF184(U6656),calmodulin(U12022),carboxypeptidase M(BC022276),katanin p60(AF056022),calcineurin binding protein cabin 1(NM_012295),transducin-like enhancer protein(TLE1,M99435)等.结论通过对基因表达谱数据的分析和挖掘,初步筛选了绒毛膜癌相关基因,为寻找绒毛膜癌发生与演进的关键基因提供了新的线索.
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关键词
绒毛膜癌葡萄胎聚类分析基因表达谱生物信息学choriocarcinomacomplete hydatidiform molegene expression profilecluster analysisbioinformatics
主题词
绒毛膜癌(Choriocarcinoma)基因(Genes)计算生物学(Computational Biology)葡萄胎(Hydatidiform Mole)基因表达谱(Gene Expression Profiling)
分类号
R737.31
栏目名称
论著·基础研究
DOI
10.3321/j.issn:1673-4254.2005.01.001
发布时间
2005-03-24
基金项目
National Natural Science Foundation of China
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