NDUFA13与CRIP1调控慢阻肺B细胞损伤并具备潜在诊断价值
Overexpressing NDUFA13 and CRIP1 improves B cell injury and lung Lesions in COPD mouse models
摘要目的 基于生物信息学方法筛选慢性阻塞性肺疾病(COPD)中与B细胞相关的生物标志物,并探究其诊断和治疗价值.方法 基于基因表达综合数据库(GEO),通过差异表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、受试者工作特征曲线(ROC)分析及孟德尔随机化(MR)研究,鉴定COPD中B细胞相关生物标志物,构建诊断列线图并进行富集分析,运用伪时间分析和细胞通讯分析探索B细胞在COPD中的潜在作用.将20只ICR小鼠分为对照组与COPD组,每组10只,采用脂多糖(LPS)联合香烟烟雾诱导法构建COPD小鼠模型并验证生物标志物表达;其中COPD组经三溴乙醇麻醉后,于第1、14天气管滴注含20 μg LPS的30 μL生理盐水,直立静置15 s,其余时间每日置于密闭烟箱内进行香烟烟雾熏吸造模,测量相关指标.结果 鉴定出两种COPD保护因子NDUFA13[优势比(OR)=0.2598,95%置信区间(CI):0.2048~0.3297,P<0.0001]和CRIP1(OR=0.2690,95%CI:0.1460~0.4970,P<0.0001)作为生物标志物.这两种基因在COPD样本中均显著下调(P<0.05),且均参与氧化磷酸化通路;在COPD诊断中表现出良好效能,基于二者构建的诊断列线图的曲线下面积(AUC)为0.79.在单细胞水平上,B细胞表现出异质性;在COPD环境中,B细胞在发育初始及终末阶段的密度均升高(P<0.05).在COPD背景下,B细胞与其他细胞(尤其是肺泡细胞)之间的相互作用及受体-配体配对显著增强(P<0.05).基础实验结果显示,生物标志物在COPD样本的转录组和蛋白水平均下调(P<0.05),与公共数据库中的表达趋势一致.结论 本研究证实NDUFA13和CRIP1可作为COPD中与B细胞相关的生物标志物,表明二者具备诊断潜力及降低COPD风险的能力.
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