不同炎症内在型细胞因子对鼻黏膜上皮细胞转录组的影响
Influence of inflammatory cytokines related to different endotypes on the transcriptome of nasal epithelial cells
摘要目的 探索慢性鼻窦炎不同炎症内在型细胞因子对原代培养的鼻黏膜上皮细胞转录组的影响.方法 体外培养的人原代鼻黏膜上皮细胞分别加入1型、2型、3型炎症内在型细胞因子干扰素γ(IFN-γ)(10 ng/ml)、白细胞介素4(IL-4)(50 ng/ml)、IL-17A(50 ng/ml)处理,48 h后收集细胞、提取RNA,进行转录组测序分析,筛选差异表达基因,进一步进行功能注释和通路富集,并分析不同类型细胞因子差异和共同调控基因.结果 原代鼻黏膜上皮细胞经3种细胞因子处理后,转录组分别出现显著变化.与对照组相比IFN-γ、IL-4、IL-17A处理分别引起650、540、192个基因表达发生显著变化.功能注释和通路富集分析显示,IFN-γ调控基因主要参与抗病毒免疫反应、抗原加工和提呈、白细胞和淋巴细胞免疫反应、NOD样受体信号等通路;IL-4主要与白细胞趋化、细胞黏附、细胞外基质与受体通路、MAPK信号通路等调控相关;IL-17A下游调控通路主要包括中性粒细胞趋化、抗细菌免疫反应、趋化因子信号通路、NF-κB信号通路等.IFN-γ、IL-4和IL-17A分别存在共同调控基因,其中DUOX2的表达可被三者共同上调.结论 不同炎症内在型细胞因子IFN-γ、IL-4、IL-17A影响鼻黏膜上皮细胞转录组基因表达,分别主要与抗病毒感染、炎症细胞趋化、抗菌免疫反应相关.
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