闽北地区牛乳源金黄色葡萄球菌分子流行特征、耐药谱和进化分析
Molecular Epidemiology,Antimicrobial Resistance,and Phylogenetics of Staphylococcus aureus Isolated from Bovine Raw Milk in Northern Fujian,China
摘要[目的]明确闽北地区规模化牧场中牛乳源金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的分子分型组成、耐药谱结构及进化特征.[方法]对 2023-2024年从闽北地区 14家牧场分离的 59株菌株开展Illumina高通量全基因组测序,进行多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)与spa分型、耐药基因检测及药物敏感性试验;构建基于核心基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的系统发育树,并结合全球公开数据绘制最小生成树(minimum spanning tree,MST).[结果]首次在闽北乳源样本中发现ST59-t437型畜禽相关耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(livestock-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus,LA-MRSA),并鉴定出区域性新分型ST9784-t189.优势型为ST1-t114(25.4%)和ST9784-t189(20.3%).菌株总体耐药率为 45.8%,其中青霉素与氨苄西林耐药率最高(28.8%),但低于国内其他地区.spa分型在菌株微进化解析中显示出较高分辨力.基于PubMLST数据库全球分离物最小生成树分析,ST398和ST1为跨洲传播双核心型,其他ST型传播受地域限制.多重耐药(multidrug resistance,MDR)菌株耐药基因种类更为丰富,分型与基因型之间存在显著关联.[结论]福建北部牛乳源金黄色葡萄球菌群体结构呈现多样化特征,整体耐药水平相对较低,但新发现的ST9784及区域首次报道的LA-MRSA ST59-t437可能具备较强的传播风险,应加强跨宿主监测.
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