换一批基于DNAzyme的d(GGA)重复序列折叠结构的可视检测
G-quadruple/Hemin DNAzyme-based Visual Detection of the Fold-ing Structure Formed by d(GGA)Trinucleotide Repeats
摘要d(GGA)重复序列形成的H(G-A七分体):T(G-四分体)型"非常规"G-四链体(G4)及其二聚体是其调控c-myb原癌基因表达的关键.该类序列也在很多其他基因中存在,被认为可能具有与其折叠相关的功能,因此判别其折叠结构是其功能研究的基础.该文发现d(GGA)4与血红素可形成高活性DNAzyme,催化裸眼可视的快速显色反应,且DNAzyme活性与其结构相关,基于此提出了可视检测d(GGA)重复序列折叠结构的策略.通过研究20条含不同侧翼和重复次数不同的d(GGA)重复序列,发现16条有高DNAzyme活性的序列具有高比例的G4二聚体,4条DNAzyme活性显著降低或接近失活的序列聚集状态很少.表明DNAzyme活性与d(GGA)重复序列折叠成的G4二聚体高度相关,基于DNAzyme活性的分析方法可用于其在实际序列中折叠结构的可视检测.
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