换一批用于高度降解mRNA样本的非反转录基因表达量测定方法
A Reverse Transcription-free Assay for Gene Expression Analysis of Highly Degraded mRNA Samples
摘要许多生物样本(如石蜡包埋组织样本)中的mRNA易断裂为小片段,利用传统方法检测较困难.为了测定高度降解的mRNA,本研究针对待测mRNA短片段设计一对探针,当探针与待测模板杂交后,通过连接反应将两条探针5′与3′端相连,连接产物作为PCR扩增模板进行实时荧光定量检测,从而对待测mRNA进行定量测定.以人ACTB基因为待测靶标,通过测定不同浓度的待测靶标及与待测靶标序列不同的RNA片段,分别考察方法的灵敏度与特异性,并检测肺癌石蜡切片样本中ACTB基因的表达量,与传统的反转录定量PCR检测结果进行了对比.本方法的检出限为150 fmol/L,定量线性范围为150 fmol/L～300 pmol/L,并且具有良好的特异性.在对石蜡包埋组织样本中的基因表达量检测时,本方法扩增检测CT值比反转录实时定量PCR小,表明本方法更适合对高度降解的mRNA样本进行定量测定.
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关键词
连接反应基因表达量高度降解RNA实时荧光定量PCR石蜡包埋组织样本LigationGene expressionHighly degraded ribonucleic acidReal-time quantitative polymerase chain reactionParaffin-embedded tissue samples
栏目名称
DOI
10.3724/SP.J.1096.2013.21151
发布时间
2013-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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