运用18S rDNA克隆文库检测滇池硅藻种群多样性
Application of 18S rDNA Clone Library to Detect Diatom Population Diversity in Dianchi
摘要目的 构建18S rDNA克隆文库检测滇池硅藻种群的多样性.方法 用硅藻18S rDNA特异性引物对滇池6个采集点水样的硅藻进行DNA扩增,构建硅藻18S rDNA克隆文库,随机挑取克隆子进行测序,通过BLAST进行序列比对,分析滇池硅藻种群分布,运用MEGA v7.0.14软件构建滇池水域硅藻18S rDNA系统发育树.结果 240个克隆子测序获得167条硅藻序列,包括冠盘藻属、等片藻属、直链藻属等11个硅藻种属,6个采集点间硅藻种群分布存在一定差异.结论 滇池硅藻种群分布具有一定特征,硅藻18S rDNA序列分析对法医学溺死地点推断有一定参考价值.
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