增强子RNA A2MP1在肺腺癌中的临床意义与分子机制
Clinical significance and molecular mechanism of enhancer RNA A2MP1 in lung adenocar-cinoma
摘要目的 研究增强子RNA(eRNA)A2MP1 在肺腺癌(LUAD)中的表达和关键靶基因预测,分析A2MP1 在LUAD恶性进展中的分子机制及其与靶基因相关性,探讨A2MP1 在LUAD患者中的预后作用.方法 在UCSC Xena数据库中下载 33类肿瘤的表达数据、生存数据和临床数据.已报道的eRNA及其调控的基因被选择为假定的eRNA-靶基因对.采用Kaplan-Meier生存分析和相关性分析确定关键的eRNA.A2MP1 以PZP为靶点,被鉴定为与LUAD相关的eRNA.使用χ2 检验分析A2MP1表达与患者临床病理的相关性;通过泛癌数据对结果进行验证;利用GO和KEGG富集分析探索A2MP1在LUAD中参与的信号途径.结果 利用PreSTIGE算法与Kaplan-Meier生存分析和相关性分析,筛选出A2MP1 作为目的基因,并选定PZP作为靶基因.A2MP1 的表达水平与患者的临床分期(P<0.05)、肿瘤大小(P<0.05)、淋巴结转移(P<0.05)显著相关.A2MP1低表达组患者的总体生存率显著低于高表达组患者,差异有统计学意义(P<0.05).GO结果表明,A2MP1与T细胞的活化、淋巴细胞和单个核细胞分化、抗原受体介导的信号通路、免疫反应-激活细胞表面受体信号通路等多种免疫途径密切相关.在KEGG通路分析中,PI3K/AKT和JAK-STAT信号途径被富集.泛癌验证表明头颈鳞状细胞癌、胸腺癌、肾透明细胞癌、急性髓细胞样白血病、脑低级别胶质瘤、皮肤黑色素瘤等癌症中高表达A2MP1 组中患者的总体生存率高于低表达组,差异有统计学意义(P<0.05),且A2MP1 和PZP在这些癌症中均显示出显著的相关性(P<0.05).结论 A2MP1是肺腺癌中与生存相关的关键eRNA,由于A2MP1 在免疫微环境和PI3K/AKT、JAK-STAT信号通路方面的潜在作用,可能成为肺腺癌患者新的免疫治疗靶点.
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