基于生物信息学分析跨膜蛋白132A在肝癌中的表达及其临床意义
Expression and clinical significance of transmembrane protein 132A in liver cancer based on bioinformatics
摘要目的:基于公共数据库探究跨膜蛋白 132A(TMEM132A)在肝癌中的表达模式及临床意义.方法:利用肿瘤基因组图谱并基于基因表达数据库优选其中的GSE14520、GSE60502 数据集分析TMEM132A在肝癌与癌旁组织中的mRNA表达水平,及与临床因素的相关性.通过HPA数据库获取TMEM132A在组织中的免疫组织化学结果.利用Kaplan-Meier法探讨TMEM132A与患者预后的相关性.运用受试者操作特征曲线探究TMEM132A是否可以作为诊断指标.通过癌症药物敏感基因组学预测TMEM132A对化疗药物的药物敏感性.通过单样本GSEA、TIMER、STORMAL SCORE和免疫检查点热图,对TEME132A进行免疫分析.linkedomics网站用于对TMEM132A差异基因进行基因集富集分析.利用STRING数据库预测TMEM132A的互作蛋白.结果:TMEM132A在肝癌组织表达显著高于癌旁组织(P<0.05),定位于胞浆、胞膜.TMEM132A高表达与肿瘤分期、分级、甲胎蛋白水平和体重显著正相关.TMEM132A高表达提示患者预后不良,可作为准确的诊断指标.TMEM132A对多种化疗药物敏感,且被多种免疫细胞浸润,可以作为药物治疗及免疫治疗的研究靶点.癌组织中TMEM132 的启动子甲基化水平显著降低.TMEM132A影响细胞黏附,脂肪酸代谢等信号通路.结论:TMEM132A在肝癌中高表达,与患者预后不良正相关.
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