换一批基于AutoDock Vina软件的药物化学虚拟仿真实验构建与应用
Construction and Application of Virtual Simulation Experiments with AutoDock Vina in Medicinal Chemistry
摘要目前药物化学实验偏有机合成技能的培养,忽视了药物化学课程的主要内容.因此我们尝试在药物化学实验课程中构建Oseltamivir carboxylate与神经氨酸酶的分子对接虚拟仿真实验,帮助学生理解药物与靶蛋白的作用方式,提高学习兴趣.本研究通过提前发布学习视频、靶蛋白的下载与预处理、靶分子的结构获取与预处理、AutoDock vina参数设置与对接、PyMOL软件分析结果与图片制作以及学生PPT汇报结果等实验内容.该实验的实施将帮助学生掌握分子对接的基本技能,深入理解立体化学结构对药物与靶蛋白相互作用的影响,提高学生学习药物化学的兴趣,为AutoDock vina软件在药物化学教学中的应用提供参考.
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关键词
药物化学AutoDock vina分子对接Oseltamivir carboxylate神经氨酸酶medicinal chemistryAutoDock vinamolecular dockingoseltamivir carboxylateeuraminidase
分类号
R95（药事组织）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1007-1865.2023.16.077
发布时间
2023-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
湖南省自然科学基金项目（2022JJ50294）
湖南省教育厅科学研究项目（22B1036）
湖南省高等学校教学改革研究项目（HNJG-2021-1225）
湖南省高等学校教学改革研究项目（HNJG-2022-1316）
湖南医药学院教学改革研究项目（2021JG17）
湖南医药学院教学改革研究项目（2022JG13）
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