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一株芽孢杆菌16S rRNA的基因序列测定和系统进化分析

Sequencing and phylogenetic analysis of the partial 16S rRNA in a Bacillus strain

摘要从河南黄河稻区土壤中分离出一株具有较强稻瘟病菌拮抗活性的芽孢杆菌菌株BS501,经过形态观察、生理生化特性检测和电镜技术,确定其为芽孢杆菌属细菌,为进一步确定其分类学地位,扩增了 BS501基因组的16S rDNA.并将测序结果提交GenBank数据库(登录号:FJ755787).利用BLAST软件将该序列与枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌等芽孢菌属细曲及大肠杆菌16S rDNA序列进行同源性比对.系统进化树表明,BS501与芽孢菌属细菌存进化关系上组成一个大的分支,与枯草芽孢杆菌最为接近,与大肠杆菌较远.同源性分析表明该序列与枯草芽孢杆菌PRE23同源性达99%,证实该菌株的分类学地位为枯草芽孢杆菌.

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分类号 R382.2
栏目名称 生物技术
DOI 10.3969/j.issn.1004-874X.2011.03.045
发布时间 2011-07-05
基金项目
河南省教育厅自然科学计划项目 郑州市科技攻关项目
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