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广东省猪圆环病毒2型毒株分离及全基因序列分析

Isolation and sequence analysis of PCV2 strains from Guangdong province

摘要为了解广东省猪圆环病毒2型(PCV2)的流行、变异及进化情况,对2013年广东省多个猪场发生PCV2感染的病猪血清进行PCV2病毒分离,参考GanBank上已发表的PCV2全基因序列,设计3对引物,用PCR方法扩增其全基因序列,测序并进行序列分析.结果分离到9株PCV2毒株,全基因序列长度都为1 767 bp.同源性分析表明,9株PCV2分离株核苷酸同源性为93.6%~99.4%,与2012年分离株同源性为94.5%~99.7%,与2011年分离株同源性为94.2%~99.7%,与GenBank中其他PCV2分离株的同源性为93.2%~99.7%.9株PCV2的ORF2核苷酸及其推导的氨基酸序列同源性分别为89.0%~99.9%和86.4%~ 100%,存在一定的变异.基因型分析表明,有5株属于PCV2d,3株属于PCV2b,1株属于PCV2a.对2011-2013年分离的PCV2基因组特征进行分析,发现PCV2核苷酸序列比较稳定,与世界其他分离株也具有较高的同源性.

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作者 孟张丽 [1] 梁鹏帅 [2] 夏平安 [3] 刘燕玲 [2] 李艳 [2] 蒋智勇 [2] 蔡汝健 [2] 宋长绪 [1] 学术成果认领
分类号 Q781
栏目名称 生物技术
DOI 10.3969/j.issn.1004-874X.2014.07.038
发布时间 2014-06-06
基金项目
广东省科技计划项目 广州市科技计划项目 广东省生猪产业体系项目 广东省农业科学院院长基金
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