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鹅Caspase-1基因的克隆与序列分析

Cloning and sequence analysis of Caspase-1 gene in Chinese goose

摘要为系统了解鹅炎症系统,用Trizol法提取马岗鹅脾脏总RNA,采用兼并引物RT-PCR方法克隆了马岗鹅Caspase-1基因并进行了系统的生物信息学分析.测序结果显示,go-Caspase-1基因完整ORF区长813 bp,编码270个氨基酸(GenBank 序列号为MG463109).同源性分析显示,go-Caspase-1基因序列与鸭、鸡等禽类的同源性较高,与其他物种的差异较大.蛋白质功能结构域分析显示,不同物种间Caspase-1蛋白的Caspase结构域高度相似.蛋白三维结构预测比较显示,go-Caspase-1蛋白空间结构与鸡和人的Caspase-1主体结构相似.

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