摘要[目的]从线粒体DNA(mtDNA)D-loop全序列角度评估麒麟鸡的遗传多样性水平,以期阐明麒麟鸡的品种形成.[方法]通过PCR产物直接测序法对麒麟鸡保种群的黄羽、白羽和黑羽 3 个资源群及 8 个地方鸡品种进行mtDNA D-loop全序列测定,分析遗传变异,并进行中性检测,构建单倍型中介网络图,探究麒麟鸡的群体历史.[结果]麒麟鸡mtDNA D-loop全序列为1231～1232 bp,C+G含量(39.8％)低于T+A含量(60.2％),总体核苷酸多样性为 0.00630±0.00054,明显高于其他 8 个地方鸡品种.3 个资源群黄羽、白羽和黑羽麒麟鸡的单倍型多样性分别为0.777±0.076、0.816±0.060、0.710±0.057,核苷酸多样性分别为0.00699±0.00115、0.00662±0.00090、0.00546±0.00062,遗传多样性水平基本上与群体规模呈正相关.麒麟鸡与 8 个地方鸡的双参数遗传距离为 0.008～0.009,净遗传距离为 0.003～0.005,均大于其他地方鸡之间的遗传距离.90 份麒麟鸡样本共检测到45 个突变位点,定义了 17 个单倍型,其中独享型单倍型 9 个,单倍型多样性为 0.773±0.039.黄羽、白羽和黑羽麒麟鸡的单倍型数量分别为12、7、5个.8个地方鸡品种定义了19个单倍型,其中河田鸡的单倍型数量最多(8个),宁都黄鸡的最少(3 个),没有与麒麟鸡共享的单倍型.中性检测结果显示,除了黑羽麒麟鸡外,供试鸡种在品种水平上近期均未经历明显的种群扩张.麒麟鸡单倍型类群主要分布在进化枝A、B、C和E,优势单倍型类群是B(30.0％)和E(64.4％);8 个地方鸡单倍型类群主要为A和B.[结论]独特的单倍型提示麒麟鸡具有独立的品种形成历史,相对较高的遗传多样性水平将有利于其保护和利用工作的开展.