一株鹅源细小病毒的分离鉴定与遗传进化分析
Isolation,Identification,and Genetic Evolutionary Analysis of a Goose Parvovirus Strain
摘要小鹅瘟是由鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV)引发的传染病,20日龄内雏鹅具有高致死性,而青年鹅常表现为隐性感染,易被忽视.2024年11月,广东揭阳某地养鹅场青年鹅群(56日龄)急性发病,为明确病因,针对送检的病死鹅进行剖检并无菌采集肝、脾和肠组织样本,通过PCR/RT-PCR方法对常见鹅病毒性传染病病原核酸进行检测.将GPV阳性组织样本研磨处理后接种至鹅胚,随后对PCR阳性尿囊液样本进行全基因组克隆测序,并基于获得的序列数据开展系统发育与分子进化分析.结果显示,送检组织样品中鹅细小病毒核酸呈阳性,鹅圆环病毒(Goose circovirus,GoCV)、鹅星状病毒(Goose astrovirus,GoAstV)、新城疫病毒(Newcastle Disease Virus,NDV)和坦布苏病毒(Tembusu virus,TMUV)核酸均为阴性.阳性病料组织悬液接种鹅胚后,鹅胚死亡且胚体严重出血,鹅胚尿囊液PCR检测为GPV阳性.测序结果显示,毒株基因组全长为5 028 bp,由ITR区域和NS、VP基因构成,将该毒株命名为GPV/GD/3121/2024株.相似性分析显示,该分离株与DY16株的NS1和VP1基因相似性最高,分别达到99.4%和95.9%.GPV/GD/3121/2024株与国内近年GPV分离株(DY16株、RC16株和HB-2019株)全基因序列相似性高达97.5%.基于全基因组序列、非结构蛋白NS1和结构蛋白VP1序列的遗传演化分析均显示,分离株与欧洲疫苗株(VG32/1)、中国大陆疫苗株(GDaGPV、SYG61v)和台湾疫苗株(82-0321V)均同属一个大分支,遗传关系较近.此外,与经典GPV毒株相比,GPV/GD/3121/2024株VP1基因含有3个特有的碱基突变位点,分别为A2496T、G2515C、A2772G,这些突变导致VP1结构蛋白发生V38L、S178T和Y491H氨基酸位点改变.该研究确定了该场青年鹅发病致死系感染GPV所致,并对毒株进行分离鉴定和遗传进化分析,同时简要比较了国内GPV的分子特征,为该病毒的生物学特性研究和科学防控提供了参考信息.
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