换一批胰腺导管腺癌微生物亚型分析揭示肿瘤微环境异质性
Intratumoral microbial subtyping in pancreatic ductal adenocarcinoma reveals tumor microenvironment heterogeneity
摘要目的 探究胰腺导管腺癌(PDAC)微生物亚型及其与宿主基因组、肿瘤微环境的相互作用.方法 整合来源于GEO数据库的PDAC转录组数据和来源于BioProject数据库的PDAC宏基因组数据,通过非负矩阵分解(NMF)聚类确定PDAC肿瘤微生物亚型,对各亚型微生物组及转录组进行差异分析;采用生存分析确定有预后意义的微生物.采用免疫浸润分析对各亚型对应的肿瘤微环境进行对比,并采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)解析共表达网络中微生物-基因组互作.结果 数据库分析显示,PDAC微生物可分为C1[威克斯氏菌科(Weeksellaceae)为主]、C2[鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)为主]、C3[假单胞菌科(Pseudomonadaceae)为主]三种亚型,其中C3亚型α多样性最高但患者预后相对较差.C3亚型中抗菌通路异常激活,且肿瘤微环境呈现出免疫抑制的特征.WGCNA揭示短波单胞菌属与肿瘤基因组互作最显著,涉及氧化代谢、PI3K/AKT等通路.结论 本生物信息学研究表明,PDAC微生物各亚型的异质性通过调控宿主基因组及免疫微环境影响肿瘤进展,C3亚型的高多样性与不良预后特征提示其作为潜在治疗靶点的价值.
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关键词
胰腺导管腺癌肿瘤微生物肿瘤微环境宿主-微生物互作非负矩阵分解加权基因共表达网络分析pancreatic ductal adenocarcinomatumor microbiometumor microenvironmenthost-microbe interactionsnon-negative matrix factorizationweighted gene co-expression network analysis
分类号
R735.9（消化系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.11952/j.issn.1007-1954.2025.06.008
发布时间
2025-06-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
浙江省医药卫生科技计划（2025KY1506）
浙江省自然科学联合基金项目（KLY25H160064）
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