mNGS在老年社区获得性肺炎病原学诊断的临床价值
Clinical value of mNGS in pathogen diagnosis of elderly patients with community-acquired pneumonia
摘要目的 分析宏基因二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在老年社区获得性肺炎(community acquired pneumonia,CAP)病原学检测的临床价值.方法 以收治的112例老年CAP患者为研究对象,比较mNGS与常规微生物学试验(sconventional microbiological tests,CMTs)对病原体的检出效率.采用Fisher精确检验统计及ROC曲线分析其结果,比较mNGS与CMTs的诊断性差异.结果 mNGS对老年CAP患者的总诊断率优于CMTs,差异有统计学意义(94.6%vs.65.2%,P<0.001);mNGS的检测时间显著低于 CMTs 的检测时间[(26.3±5.9)h vs.(85.5±6.4)h;t=21.034,P<0.05].mNGS 在细菌、病毒、真菌、非典型病原体的检测例数均高于CMTs.mNGS对混合感染标本检出率为76.4%,明显高于CMTs的60.3%(x2=6.851,P<0.05).mNGS与CMTs的病原体检测一致者64例,部分一致者35例,完全不一致者13例.结论 mNGS对老年社区获得性肺炎能检测出更多和更广谱的病原体,且具有重要的临床价值.
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