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肠道病毒71型SHZH03株5'-UTR区遗传进化分析

Evolution analysis of 5'-UTR of enterovirus 71 SHZH03

摘要目的 构建肠道病毒71型SHZH03、SHZH98、SHZH-001以及具有中枢神经毒性的MS株的5'-UTR序列的系统发育树,研究我国肠道病毒71型的神经毒性和分子流行病学.方法 以肠道病毒71型SHZH03株的基因组RNA为模板,通过RT-PCR方法,扩增5非编码区(5'-UTR)序列,将其克隆至pGEM -T载体中,对其进行序列测定,与我国早期分离的肠道病毒71型SHZH98、SHZH-001以及具有神经毒性的肠道病毒71型标准株MS的5'-UTR序列进行比较分析.结果 SHZH03株的5'-UTR序列全长743 bp,与SHZH98株的5'-UTR序列的同源性为99.2%,与具有中枢神经毒性的BrCr株的5'-UTR序列的同源性为94.2%.结论 我国分离的SHZH03株和SHZH98株的5'-UTR序列同源性高,而与具有中枢神经毒性的MS株的5'-UTR序列有较大差异.

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