换一批
换一批减蛋综合征病毒NE4株全基因组序列测定与分析
Sequencing and analysis on the complete genome of egg drop syndrome virus NE4 strain
摘要根据减蛋综合征病毒(EDSV-76)AV-127株的全基因序列(序列号BK000404),用Premier 5.0软件设计22对引物,利用PCR方法对EDSV-76病毒NE4株的全基因组进行了分段扩增、克隆和序列测定,并用DNA Star分析软件对各片段的测序结果进行拼接,将该序列与GenBank中已登录的相应序列进行同源性分析,并用六邻体蛋白构建进化树.结果表明:NE4株基因组序列全长33 214 bp,GC含量为43 %,与国际标准株AV-127相比,核苷酸序列同源性为99.6 %.碱基的插入或缺失主要在非编码区,在100K蛋白编码区距羧基端1/10处插入了1个碱基C,其ORF编码696个氨基酸,而AV-127株100K蛋白编码709个氨基酸,预计其发挥功能的基团在N端.蛋白同源性分析表明,EDSV NE4株主要蛋白与羊腺病毒OAV(Ovine adenovirus D)、牛腺病毒BAV(Bovine adenovirus D)和蛇腺病毒SAV(Snake adenovirus)有较高的同源性,而与禽腺病毒Ⅰ群(CELO)的同源性较低,说明NE4株与禽腺病毒Ⅰ群亲缘关系较远,进化树分析也证实了此特性.
更多相关知识
- 浏览0
- 被引4
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
