换一批马铃薯品种和组织对基因组测序深度分布模式的影响
Effects of potato cultivars and tuber sections on the sequencing depth pattern in genome
摘要【目的】探讨品种和组织对马铃薯基因组测序深度分布的影响。【方法】对‘布尔班克’和‘云薯107’2个品种的薯块芽端和茎端进行了深测序，建立了在参照基因组上的测序深度分布图。【结果】发现这些分布在品种间有明显差别（例如在三号染色体中部和尾部），在同一品种的DNA样本间很类似，但芽端和茎端在二号染色体有明显差别。这些结果说明测序深度的分布主要受品种基因组本身所影响，也受薯块上部位影响，而且在很大程度上可以重复。【结论】这些结果能帮助设计试验和合适利用测序深度。
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关键词
马铃薯DNA测序小序列片段参考基因组覆盖程度品种差别组织特异性potatosecond generation DNA sequencingsmall sequence fragmentsreference genomecoverage depthcultivars differencetissue-specific variation
分类号
S532
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1003-4315.2016.03.007
发布时间
2016-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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