换一批浅析基于形态特征的贝叶斯系统发育分析的不确定性
Uncertainty in Bayesian phylogenetic analysis using morphological data:A brief overview
摘要系统发育分析通过形态特征或分子性状帮助理解不同生物类群的演化历史.化石作为许多已灭绝生物的唯一遗存,为研究地球生命多样化提供了宝贵的机会.这使得基于离散型形态特征的系统发育分析在探讨生物的起源与早期演化方面发挥着不可或缺的作用.系统发育分析方法多样,早期常常依赖最大简约法对化石形态特征进行分析.近年来,基于模型的贝叶斯系统发育分析在古生物学中获得越来越多的重视.贝叶斯系统发育分析可以提供准确且易解释的系统发育关系,并为不确定性提供评估指标.本文旨在讨论系统发育分析过程中的不确定性影响因素,如数据集、替换模型以及马尔科夫链,以此提高对系统发育分析结果的可信度.在本文的案例中,利用已发表的苔藓虫数据集探讨不同版本的Mk模型和马尔可夫链的稳定性对系统发育树的影响.研究结果表明这些因素对系统发育树的后验概率和拓扑结构都有一定影响,这意味着在系统发育分析中需要仔细分析这些因素,选择合适的模型.
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关键词
系统发育分析形态学数据贝叶斯法不确定性Phylogenetic analysismorphological dataBayesian methodphylogenetic uncertainty
栏目名称
DOI
10.19800/j.cnki.aps.2024041
发布时间
2025-06-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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