换一批基于GEO芯片数据筛选铁死亡参与肝细胞癌的核心基因及中药治疗预测
Screening of Core Genes Involved in Ferroptosis in Hepatocellular Carcinoma Based on GEO Microarray Data and Prediction of TCM Treatment
摘要目的:基于生物信息学筛选铁死亡参与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的核心基因,并预测潜在干预中药.方法:利用基因表达汇编(gene expression omnibus,GEO)数据库下载GSE39791芯片数据筛选HCC差异表达基因,对差异上调、下调基因分别进行富集分析;通过铁死亡数据库(ferropto-sis database,FerrDb)检索铁死亡相关基因,绘制HCC差异基因与铁死亡相关基因的韦恩图,取交集基因.下载肝细胞癌GSE57957芯片数据验证交集基因的差异表达;借助Coremine数据库预测干预交集基因的潜在中药,筛选出可能通过调控铁死亡干预HCC的中药.结果:共获得301个差异表达基因,其中上调基因45个,下调基因256个;获得259个铁死亡相关基因;与铁死亡相关的HCC差异表达基因共10个,分别是AKR1C3、HSPB1、MT1G、HAMP、CXCL2、GABARAPL1、NNMT、GPT2、CBS、HBA1;预测得到乳香、合欢花、红参等46味中药.结论:基于生物信息学筛选可能参与铁死亡以干预HCC的中药,为临床用药及基础研究提供了新思路.
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分类号
R285（中药学）
栏目名称
DOI
10.12174/j.issn.2096-9600.2026.03.16
发布时间
2026-04-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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