基于网络药理学和分子对接技术探讨败酱草-赤芍药对治疗结肠直肠癌的作用机制

Mechanism of Herba Patriniae-Paeoniae Radix Rubra herb pair in the treatment of colorectal cancer based on network pharmacology and molecular docking

导出原文传递学术成果认领

摘要目的基于网络药理学和分子对接技术探讨败酱草-赤芍药对治疗结肠直肠癌(CRC)的作用机制.方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索并筛选败酱草、赤芍的有效成分及靶点,在GeenCards、DrugBank、BharmGKB数据库中查找CRC相关靶点;使用Cytoscape 3.8.0软件绘制有效成分-疾病-靶点可视化网络图,通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,得核心基因;利用R软件及相关软件包对结果进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,对得到的核心成分和核心靶点借助AutoDock Vina软件进行分子对接.结果从败酱草-赤芍药对中挖掘出有效成分42种,潜在靶点1486个,CRC相关靶点2976个,最终得到药物和疾病共有靶点143个;治疗疾病的重要靶点有骨髓瘤细胞癌基因(MYC)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)14、原癌基因蛋白(FOS)、缺氧诱导因子1α(HIF1A)、MAPK1,主要作用于p53、磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K-Akt)、白细胞介素-17(IL-17)、肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路;分子对接结果显示,败酱草-赤芍药对的主要化合物和核心靶点之间结合能均小于-7 kcal/mol,结合良好.结论败酱草-赤芍可能通过调节MYC、MAPK14、FOS、HIF1A、MAPK1等靶点发挥抗肿瘤、抗炎、抗病毒、抗氧化等功效,从而发挥治疗CRC的作用.