换一批靶向Nur77的抗炎候选药物筛选与分子动力学研究
Screening of Anti-inflammatory Drug Candidates Targeting Nur77 and Molecular Dynamics Study
摘要目的 本研究旨在使用计算方法识别针对Nur77-LBD(配体结合结构域)位点C的新型配体,该位点是炎症的关键调节结合位点.方法 基于Nur77配体结合结构域(PDB ID:4JGV)的结构,使用分子对接筛选9 371种DrugBank化合物.使用Schr?dinger Desmond模块对得分最高的命中化合物进行500 ns分子动力学(MD)模拟.通过均方根偏差(RMSD)、均方根波动(RMSF)和蛋白质-配体相互作用分析以及MM-GBSA(分子力学/广义Born表面积法)计算评估结合稳定性.结果 识别出5个候选化合物具有潜在结合Nur77-LBD的能力.其中,化合物1、2和3表现出稳定的结合,RMSD波动较低,蛋白质-配体相互作用持续且可相比参考配体13和29.结论 化合物1作为最有希望的候选化合物,表现出全面的结合稳定性和相互作用强度,为进一步优化Nur77调节剂提供了新的化学骨架.
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关键词
Nur77(NR4A1)孤儿核受体虚拟筛选分子动力学模拟Nur77(NR4A1)orphan nuclear receptorsvirtual screeningmolecular dynamics simulations
分类号
R914.2（药物基础科学）
栏目名称
DOI
10.12048/j.issn.1674-229X.2026.05.005
发布时间
2026-06-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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