换一批
换一批高良姜倍半萜合成酶基因的生物信息学和表达分析
Bioinformatics and expression analysis of sesquiterpene synthase gene in Alpinia officinarum
摘要目的 明确高良姜倍半萜合成酶(sesquiterpene synthase,SES)基因及其编码蛋白的序列特征,以及在高良姜不同组织中的表达差异.方法 基于前期建立的高良姜转录组数据,鉴定出SES基因的编码区序列,采用生物信息学分析SES基因编码蛋白的特征和功能,并运用实时荧光定量PCR(qPCR)检测SES基因在高良姜中的表达模式.结果 在转录组数据中获得2个高良姜SES基因,分别命名为AoSES3和AoSES6.AoSES3和AoSES6的编码区长度分别为1653 bp和1647 bp,它们的编码蛋白为亲水性、混合型结构,均含有植物萜类环化酶和萜类合成酶等特异性功能域,且没有跨膜结构域、信号肽、转运肽、靶向肽等结构.编码蛋白AoSES3和AoSES6与其他植物来源倍半萜合成酶具有较高的序列相似度.AoSES3和AoSES6在高良姜叶片、茎和根茎中均有表达,AoSES3在叶片中表达最高,而AoSES6则在根茎中表达最高.结论 成功获得了2个高良姜SES基因,为后续利用这些基因调控高良姜倍半萜类成分的生物合成奠定基础.
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