基于网络药理学及分子对接探讨肝胃同调汤治疗消化性溃疡病的作用机制
Mechanistic insights into Gan-Wei Tongtiao Decoction for peptic ulcer treatment:an integrated approach of network pharmacology and molecular docking
摘要目的 利用网络药理学和分子对接的方法探讨肝胃同调汤防治消化性溃疡(PU)的潜在作用机制.方法 利用TCMSP平台筛选肝胃同调汤的药物活性成分及靶点,并用UniProt数据库进行靶点标准化与校正;从Gene-Cards、DrugBank、OMIM和TTD数据库获取PU相关疾病靶点;并通过Venny2.1.0在线工具得到肝胃同调汤的活性成分作用靶点与PU相关靶点的共同靶点;借助Cytoscape3.10.3建立"药物—活性成分—共同靶点"网络图;将共同靶点导入STRING数据库获得蛋白—蛋白互作(PPI)网络图;用DAVID数据库进行核心靶点的功能及通路富集分析;用CB-Dock2进行分子对接验证及使用PyMOL将结果可视化.结果 从肝胃同调汤中筛选出药物活性成分251 个,药物靶点131个,疾病靶点1 696个,共同靶点90个;经PPI及网络拓扑分析后,获取核心靶点10个,分别是蛋白激酶(APKIA)、凝血因子X(F10)、谷胱甘肽S-转移酶M 1(GSTM1)、细胞色素P450家族2亚家族C成员9(CYP2C9)、分泌性白细胞蛋白酶抑制剂(SLPI)、谷胱甘肽依赖性前列腺素E合酶(PTGES)、促肾上腺皮质激素(CRH)、紧密连接蛋白4(CLDN4)、胆碱能受体毒蕈碱5(CHRM5)及胆碱能受体毒蕈碱3(CHRM3);经活性成分—核心靶点网络的构建及网络拓扑分析,得到肝胃同调汤防治PU主要活性成分10个,分别是槲皮素、山柰酚、豆甾醇、β-谷甾醇、木犀草素、金合欢素、前德醇、汉黄芩素、7-甲氧基-2-甲基-3-(4-硝基苯基)铬-4-酮及柚皮素;GO富集到基因功能628个(P<0.01),KEGG富集到基因通路165条(P<0.01),结果表明,肝胃同调汤防治PU的作用机制是通过调节FoxO及Toll-like receptor等信号通路来发挥防治PU的作用.分子对接验证结果显示,筛选的关键活性成分及核心靶点对接的结合能均<—6 kJ/mol,说明分子对接结果良好.结论 初步揭示了肝胃同调汤防治PU的有效成分和可能的作用机制,并为深入研究药效物质基础、作用机制以及临床应用提供了科学参考.
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