角蛋白18在卵巢癌中的表达特征及其与患者生存和肿瘤免疫微环境的关系
Expression Characteristics of KRT18 in Ovarian Cancer and Its Association with Patient Survival and Tumor Immune Microenvironment
摘要目的:基于多组学数据库系统分析角蛋白18(keratin 18,KRT18)在卵巢癌中的表达特征及其与患者生存和肿瘤免疫微环境的关系.方法:整合癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、GTEx、GEO(GSE66957)数据库转录组数据分析KRT18 mRNA和基因表达差异,并结合CPTAC蛋白质组数据库及HPA数据库免疫组织化学检查结果验证KRT18蛋白水平.采用Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存分析,利用TIMER 3.0分析KRT18基因表达水平与肿瘤免疫细胞浸润的相关性,结合基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)及STRING数据库进行功能富集和蛋白质-蛋白质互作网络分析.通过TISCH2数据库中的单细胞转录组数据分析KRT18基因在不同细胞亚群中的表达分布.结果:卵巢癌组织中KRT18 mRNA、基因及蛋白均显著高于正常卵巢组织(均P<0.05).生存分析显示KRT18基因高表达组与低表达组的总生存期和无进展生存期差异均无统计学意义(均P>0.05).KRT18基因表达与M1型及M2型巨噬细胞、中性粒细胞、初始CD8+T细胞、记忆B细胞及未成熟浆细胞浸润水平呈负相关,与初始B细胞浸润水平呈正相关(均P<0.05).GSEA分析提示其相关通路涉及抗原加工与呈递相关生物过程及小GTP酶信号通路等.单细胞转录组分析显示KRT18基因在恶性肿瘤细胞及成纤维细胞中表达相对较高.结论:KRT18在卵巢癌中稳定高表达,其表达水平与免疫微环境构成存在相关性,提示其可能参与卵巢癌的发生发展过程.
更多相关知识
- 浏览4
- 被引0
- 下载2

相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文


换一批



