高毒力艰难梭菌的基因型和毒力相关基因检测

Detection of genotype and toxin associated gene of hypervirulent Clostridium difficile clinical isolates

二维码有效期 120s

摘要目的：鉴定莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株的基因型和毒素相关基因的携带情况。方法22株莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株收集自澳大利亚悉尼地区，利用基于荧光毛细管电泳的聚合酶链反应（PCR）‐核糖体分型技术对其进行基因分型；利用PCR方法检测其毒素A、B编码基因 tcdA、tcdB和二元毒素编码基因cdtA 、cdtB；利用PCR‐基因测序方法检测毒素调节基因tcdC的基因序列，通过与参考菌株VPI 10463（Genbank收录号：X92982）比对了解其基因突变情况，通过与Genbank中的序列比对确定其序列型。结果21株菌株为高毒力核糖体型027（RT027），另1株为RT078；22株菌株毒力编码基因均为 tcdA＋tcdB＋ cdtA＋ cdtB＋；21株RT027 tcdC序列型为sc1，另1株RT078序列型为WA39，与参考株VPI 10463比较，RT027菌株tc‐dC序列均出现连续18个核苷酸（nt330‐347）的缺失和第117位单核苷酸的缺失，RT078菌株则出现连续39个核苷酸（nt341‐379）的缺失和第184位（C＞ T ）的突变。结论高毒力 RT027是最常见的莫西沙星耐药的艰难梭菌基因型；高毒力 RT027和RT078均携带毒素A、B和二元毒素编码基因，且毒素调节基因 tcdC均存在基因突变。

作者肖克林 ^[1] 金萍 ^[2] 黄丽清 ^[3] 梁霞 ^[4] 周天祥 ^[3] 王中兴 ^[3] 王秦宁 ^[5] 孔繁荣 ^[5] 学术成果认领

作者单位深圳市宝安区妇幼保健院中心实验室,广东深圳,518133 ^[1] 深圳市宝安区妇幼保健院儿科ICU,广东深圳,518133 ^[2] 深圳市宝安区妇幼保健院检验科,广东深圳,518133 ^[3] 深圳市宝安区妇幼保健院药剂科,广东深圳,518133 ^[4] 悉尼大学韦德特米德医院感染性疾病和微生物中心，澳大利亚悉尼 2145 ^[5]

关键词艰难梭菌基于荧光毛细管电泳的PCR-核糖体分型毒素A B 二元毒素毒素调节基因 Clostridium difficile sequencer capillary gel electrophoresis based PCR-ribotyping toxin A and B binary toxin toxin regulator gene

主题词毒力(Virulence)基因(Genes)基因型(Genotype)核糖体(Ribosomes)基因, 调节(Genes, Regulator)

栏目名称论著

DOI 10.3969/j.issn.1673-4130.2015.08.005

发布时间 2015-05-19