PCR和HRM两种方法检测细菌耐药基因aac(6′)-Ib-cr的比较研究
Comparison of PCR and HRM for detecting bacterial drug resistance gene aac (6′)- Ib-cr
摘要目的:研究聚合酶链反应(PCR)和高分辨熔解技术(HRM)两种方法检测细菌耐药基因氨基糖苷乙酰转移酶的变异基因(aac(6′)-Ib-cr)检出率的差异性。方法采用PCR方法检测299株临床常见的革兰阴性杆菌的aac(6′)-Ib基因,并以内切酶BtsCI酶切消化aac(6′)-Ib的PCR阳性产物以确定 aac(6′)-Ib-cr;同时采用 HRM技术检测以上所有菌株的 aac(6′)-Ib 和 aac (6′)-Ib-cr基因。结果 PCR和酶切法共检出 aac(6′)-Ib 基因29株,其中有21株变异为 aac(6′)-Ib-cr,变异率为72.4%(21/29)。而且 HRM技术检测的结果与其完全一致。结论 PCR和 HRM两种方法检测细菌耐药基因aac(6′)-Ib-cr的能力相当,可以用更简便的 HRM技术替代PCR和酶切法检测aac(6′)-Ib-cr基因,尤其适用于大量筛检。
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