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焦磷酸测序法在幽门螺杆菌克拉霉素耐药基因检测及药物疗效评价中的应用

Application of pyrophosphate sequencing in detection of clarithromycin-resistance gene of Helicobacter pylori and evaluating drug effectiveness

摘要目的 本研究建立了幽门螺杆菌(Hp)克拉霉素耐药基因检测的焦磷酸测序方法,在获知耐药情况的同时根据半定量结果初步评估治疗效果.方法 通过考察最合适的扩增引物、体系、退火温度建立最优的PCR扩增体系.分别对方法的灵敏度,特异性及一致性进行了评价.通过对44例临床标本的检测,比较本方法与快速尿素酶试验和13C呼气试验的检出率.结果 最优的PCR扩增体系为HiFi体系,最佳退火温度为59.8℃.本方法特异性良好,灵敏度达到100 copies/μL,与Sanger测序结果100.0%一致.36例标本快速尿素酶和焦测序法的检出率分别为48.7%和81.1%,耐药率为10.81%.8例标本13C呼气试验和焦测序法的检出率分别为75.0%和87.5%,阳性标本检出一致率为100.0%.结论 焦测序检测方法具备灵敏度高、快速、半定量的特点,为临床Hp克拉霉素耐药检测及初步疗效评价提供了一种新的方法.

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分类号 R446.5
栏目名称 论著
DOI 10.3969/j.issn.1673-4130.2020.03.002
发布时间 2020-04-10
基金项目
国家自然科学基金项目 国家自然科学基金青年科学基金项目
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