N6-甲基腺苷甲基化相关基因IGF2BP3在肾透明细胞癌的作用研究
Role of N6-methyladenosine methylation related gene IGF2BP3 in renal clear cell carcinoma
摘要目的 筛选肾透明细胞癌(ccRCC)中的关键N6-甲基腺苷(m6A)甲基化相关基因,并研究其与ccRCC预后、ccRCC细胞的迁移和侵袭的关系.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和基因型组织表达(GTEx)数据库中下载ccRCC和癌旁组织的RNA测序数据和临床数据,采用R4.1.1分析表达谱和预后,并筛选关键基因.收集10例ccRCC手术临床标本,采用定量PCR(qPCR)和免疫组织化学法分别检测基因mRNA和蛋白表达.在人ccRCC细胞系RCC23中,通过SiRNA敲减关键基因,并用CCK-8检测细胞的存活率,采用划痕试验和Transwell试验分别检测细胞的迁移和侵袭.结果 19个m6 A甲基化相关基因中仅有胰岛素样生长因子Ⅱ mRNA结合蛋白3(IGF2BP3)在ccRCC组织中高表达,且IGF2BP3高表达与ccRCC患者预后不良呈正相关.通过qPCR和免疫组织化学法在临床标本中验证了 IGF2BP3的高表达.通过小干扰RNA(siRNA)将IGF2BP3敲减后发现,RCC23细胞的存活率明显下降,且细胞的迁移和侵袭能力下降.结论 IGF2BP3可能是预测ccRCC患者预后的生物标志物和潜在的药物治疗靶点.
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