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IGF2BP1调控lncRNA NEAT1在类风湿关节炎中的作用

Role of IGF2BP1 in regulating lncRNA NEAT1 in rheumatoid arthritis

摘要目的:类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种常见的全身性自身免疫疾病,可能导致关节变形和功能障碍.本研究旨在探索胰岛素样生长因子-2 mRNA结合蛋白1(insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1,IGF2BP1)在RA中的表达水平,以及其对长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)核丰富转录本1(nuclear paraspeckle assembly transcript 1,NEAT1)稳定性的影响和在RA发病机制中的作用.方法:通过GEO(Gene Expression Omnibus)数据库获取RA数据集,并将其分为正常对照组和RA组,使用R软件分析获取N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)相关的甲基化酶的表达量并进行差异分析.分析差异表达的m6A甲基化酶与lncRNA NEAT1的相关性.通过在线网站ENCORI预测与lncRNA NEAT1结合的蛋白质,并与lncRNA NEAT1表达相关的m6A甲基化酶取交集,从而获取关键基因.通过RNA蛋白质相互作用分析实验(RNA pull-down)验证在RA滑膜细胞中NEAT1与关键基因结合的情况.通过蛋白质印迹法验证关键基因在正常滑膜细胞和RA滑膜细胞中的表达水平.在RA滑膜细胞中转染关键基因的小干扰RNA,通过real-time RT-PCR检测NEAT1在滑膜细胞中的表达水平.结果:差异分析结果显示:与正常对照组相比,共有8个m6A甲基化基因在RA组中存在差异表达,其中IGF2BP1、甲基转移酶样蛋白14(methyltransferase 14,N6-adenosine-methyltransferase subunit,MEEEL14)与lncRNA NEAT1存在相关性;ENCORI预测结果显示:共有23个蛋白质能够与lncRNA NEAT1结合,与NEAT1共表达m6A甲基化酶取交集,获得NEAT1相关m6A甲基化蛋白IGF2BP1.蛋白质印迹法显示:与正常对照组相比,RA组中IGF2BP1蛋白在RA滑膜细胞中表达升高(P<0.05);RNA pull-down结果显示IGF2BP1蛋白与NEAT1结合;real-time RT-PCR的结果表明:敲减IGF2BP1可显著降低NEAT1 mRNA表达水平(P<0.01).结论:IGF2BP1可能通过稳定lncRNA NEAT1表达参与RA发病,调控IGF2BP1水平可能是一种新的治疗RA的方法.

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