换一批
换一批2018-2021年长春市沙门菌的分子特征及全基因组分型研究
Molecular characteristics and whole genome typing of Salmonella in Changchun from 2018 to 2021
摘要本研究旨在了解2018-2021年长春市主动监测获得的沙门菌株的分子特征,揭示菌株间的亲缘关系,为沙门菌暴发溯源提供一定的依据.利用全基因组测序和生物信息学分析技术对105株沙门菌的毒力基因进行检测,并对其进行全基因组单核苷酸多态性分型(whole genome single nucleotide polymorphism,wgSNP)、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)和全基因组多位点序列分型(complete genome multilocus sequence typing,cgMLST).本研究共分析了沙门菌的144个毒力基因,结果显示:沙门菌毒力岛(Salmonella pathogenicity islands,SPIs)基因相对稳定;非分泌系统的毒力因子在不同血清型的沙门菌中的携带率相差较大.105株沙门菌的cgST型别和ST型别完全相同,共13种.主要流行株肠炎沙门菌(ST11)和沙门菌I 4,[5],12:i:-(ST34)与国外流行株亲缘关系密切.本研究证实了长春市沙门菌携带的毒力基因较稳定,主要流行株在不同时间、来源的标本中均有分布,二者分子特征与国外流行株一致,沙门菌的血清型别与其ST型别、cgST型别密切相关.
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