基于BiRNN模型的DPP-4和SGLT-2双靶点抑制剂设计

Design of dual-target inhibitors of DPP-4 and SGLT-2 based on BiRNN model

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摘要目的设计DPP-4和SGLT-2 双靶点抑制剂.方法根据现有的DPP-4和SGLT-2 活性化合物训练BiRNN模型,使其生成具有潜在活性的双靶点新分子,并使用已经报道的活性化合物构建HipHop药效团模型,通过药效团模型对新分子进行初筛,然后使用分子对接、分子动力学模拟以及结合自由能计算等方法对初筛小分子进行进一步筛选最终得到候选化合物.结果 BiRNN模型生成 7 494 个新分子,经过虚拟筛选发现化合物NM186、NM21、NM249、NM107 是相对理想的DPP-4 和SGLT-2 双靶点抑制剂.结论 NM186、NM21、NM249、NM107 可能是一种具有新型结构的DPP-4/SGLT-2 双靶点抑制剂,这一研究丰富了DPP-4和SGLT-2 双靶点抑制剂的多样性,为其开发提供新的设计思路.

作者孙定康 ^[1] 张鑫磊 ^[2] 郭凯蕾 ^[3] 李琦 ^[4] 梁佳龙 ^[5] 马丽莎 ^[2] 林佳艳 ^[2] 何金穗 ^[3] 刁春妍 ^[2] 王育伟 ^[3] 刘雪英 ^[2] 学术成果认领

作者单位陕西中医药大学药学院,陕西咸阳 712046;空军军医大学药学系药物化学与药物分析教研室,陕西西安 710032 ^[1] 空军军医大学药学系药物化学与药物分析教研室,陕西西安 710032 ^[2] 陕西中医药大学药学院,陕西咸阳 712046 ^[3] 河南大学生命科学学院,河南开封 475004 ^[4] 中国人民解放军陆军第九四六医院医疗保障中心,新疆伊宁 835000 ^[5]

关键词糖尿病 SGLT-2/DPP-4抑制剂分子对接药效团模型分子动力学模拟 diabetes SGLT-2/DPP-4 inhibitors molecular docking pharmacophore model molecular dynamics simulations

分类号 R914.2

栏目名称

实验研究

DOI 10.7501/j.issn.1674-5515.2024.07.005

发布时间 2024-08-02

基金项目

陕西省秦创原科学家+工程师队伍建设（2023KXJ-080）