换一批
换一批基于网络药理学及分子对接探讨尿石素A治疗结肠癌的作用机制
Mechanism of urolithin A in treating colon cancer on network pharmacology and molecular docking
摘要目的 通过网络药理学及分子对接探究尿石素A治疗结肠癌的主要生物过程和信号通路,阐明其作用机制.方法 通过SwissTargetPrediction、Targets SUP-PRED和Cbligand等数据库预测尿石素A药物潜在作用靶点,检索DisGeNET、OMIM、Gene Cards等数据库获得结肠癌相疾病靶点;通过Venn图获得相关交集靶点.运用STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用(PPI)网络;使用Cytoscape软件对STRING数据库筛选的靶点进行网络拓扑分析筛选关键靶点;运用David数据库对交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,最后通过分子对接明确尿石素A治疗结肠癌的作用机制.结果 预测得到尿石素A靶点260个,筛选、去重得到结肠癌疾病靶点3289个,最后得到交集靶点106个.核心靶点21个,得到蛋白激酶B1(Akt1)、表皮生长因子受体(EGFR)、胱天蛋白酶3(CASP3)、雌激素受体1(ESR1)、环加氧酶2(PTGS2)等10个核心靶点.GO和KEGG分析表示,尿石素A可能通过癌症通路、癌症相关蛋白聚糖通路等治疗结肠癌的作用.分子对接结果显示尿石素A与核心靶点对接结合能均小于-6.9 kcal/mol.结论 尿石素A可通过多靶点和多通路的途径发挥治疗结肠癌的功效.
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关键词
尿石素A结肠癌网络药理学分子对接信号通路表皮生长因子受体胱天蛋白酶3雌激素受体1urolithin Acolon cancernetwork pharmacologymolecular dockingsignaling pathwayEGFRCASP3ESR1
分类号
R965
栏目名称
实验研究
DOI
10.7501/j.issn.1674-5515.2024.09.005
发布时间
2024-10-28
基金项目
山东省重点研发计划项目
山东省自然科学基金资助项目
山东省高等学校青创科技计划团队项目
枣庄市产学研联合基金项目
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