基于网络药理学与分子对接技术探讨小檗皮治疗2型糖尿病的作用机制
Mechanism of Berberidis Cortex in treating type 2 diabetes mellitus based on network pharmacology and molecular docking
摘要目的 探讨小檗Berberis kansuensis Schneid.皮治疗2 型糖尿病的药效物质与作用机制.方法 基于藏药小檗皮入血成分,利用SwissADME、TCMSP和Swiss Target Prediction数据库分别开展活性成分初筛、潜在作用靶点预测,其次利用GeneCards、DisGeNET和DrugBank数据库获取 2 型糖尿病相关靶点,STRING数据库构建靶点蛋白相互作用(PPI)网络筛选核心靶点,根据筛选结果应用R语言开展基因本体(GO)生物功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,最终利用Cytoscape 3.10.1 软件构建"药材-入血成分-靶点-通路-疾病"互作网络筛选核心成分与关键靶点,以及开展分子对接验证"核心成分-关键靶点"的生物活性.结果 活性初筛得到 28 个候选活性成分,经Swiss Target Prediction预测后,得到 571 个成分作用靶点;网络药理学分析结果发现,小檗皮与 2 型糖尿病有306个交集靶点,小檗皮可能通过 8-氧化小檗碱、蟾毒色胺、蟾毒色胺内盐、小檗碱、药根碱等成分,分别作用于磷脂酰肌醇 3-激酶催化亚型(PIK3CA)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(MAPK1)、B细胞κ轻肽基因增强子抑制因子(IKBKB)、蛋白激酶B1(Akt1)和表皮生长因子受体(EGFR)等关键靶点,调节磷脂酰肌醇 3 激酶(PI3K)/Akt、MAPK、肿瘤坏死因子(TNF)和核因子-κB(NF-κB)等信号通路,协同发挥抗糖尿病作用.结论 通过整合入血成分鉴定、网络药理学与分子对接结果,预测了小檗皮治疗 2 型糖尿病的潜在药效成分和作用靶点,为揭示小檗皮的药效物质基础及其作用机制研究提供参考,也为小檗皮治疗 2 型糖尿病的深入研究提供靶向.
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