换一批
换一批摘要目的:筛选结肠癌(CC)中差异性表达的自噬相关基因(ATGs),并分析其临床意义.方法:从HADb和MSigDB数据库收集ATGs,并联合TCGA数据库(结肠癌患者)的mRNA数据及临床信息,采用R软件筛选出差异表达的ATGs,并对其进行GO功能分析及KEGG通路富集分析.单因素及多因素Cox回归模型分析预后相关的ATGs,构建患者预后指数评分模型(PIS)鉴定影响患者预后的关键基因.绘制生存曲线(KM)验证关键基因对结肠癌患者预后的作用,验证关键基因与临床参数的相关性,并通过qRT-PCR证实关键基因在组织标本中的表达差异.结果:从获得的601个ATGs中筛选出85个差异性表达的ATGs(DEARGs),提示与自噬密切相关(FDR＜0.05,|log2FC|＞1).Cox回归模型筛选出4个与患者预后相关的ATGs(ATP6V1B1、UCHL1、ATP6V1C2、TUBA4B).PIS预后模型鉴定ATP6V1C2为关键基因(P=0.02).KM生存曲线揭示ATP6V1C2高表达与结肠癌患者的不良预后成正比(P=0.0027).TCGA结肠癌患者临床分期越晚、淋巴结转移程度越高、有远处转移发生,ATP6V1C2的表达水平越高(P＜0.05).ATP6V1C2在结肠癌肿瘤组织中表达水平显著高于正常癌旁组织(P＜0.01).结论:ATP6V1C2或可成为结肠癌患者预后的有效监测指标.
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