换一批LncRNA-miRNA-mRNA网络分析揭示TDRG1在低级别胶质瘤对癌症进展的促进作用
LncRNA-miRNA-mRNA network analysis reveals the promoting role of TDRG1 in cancer progression of low-grade glioma
摘要目的:探讨竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络是否与低级别胶质瘤(LGG)的进展风险相关,并寻找如TDRG1等潜在的长链非编码RNA(lncRNA)分子标记用于LGG的作用研究和评估.方法:使用美国癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的530个样本、中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)的198个样本以及广西医科大学附属肿瘤医院的3个样本的转录组学、基因组学以及临床数据和实验验证,全面分析LGG进展患者的显著差异表达基因(DEGs).根据DEGs构建lncRNA-微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)网络,通过生物信息学方法对候选lncRNA进行功能分析.利用病毒构建高精度C57BL/6J小鼠胶质瘤模型进行体内功能验证.结果:共定出35个LGG进展相关差异基因,功能富集于信号肽和免疫通路.差异表达指数与IDH1、TP53、PTEN、EGFR、CDKN2A突变显著关联(P＜0.05).ceRNA网络分析揭示TDRG1等lncRNA靶向miR-30、miR-513调控胶质瘤进展.生存分析显示miR-30、miR-1254、TDRG1表达上调显著缩短生存期(P＜0.05).RNA测序与qPCR证实TDRG1在LGG中特异性高表达(P＜0.05),小鼠模型中TDRG1显著促进胶质瘤生长(P＜0.05),表明其在LGG进展中的核心作用.结论:TDRG1与LGG的进展密切相关,值得进一步探索其在LGG中的功能及临床应用价值.
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关键词
低级别胶质瘤长链非编码RNA竞争性内源性RNA网络TDRG1生物标志物low-grade gliomalong non-coding RNAcompetitive endogenous RNA networkTDRG1bio-marker
分类号
R739.41（神经系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.16190/j.cnki.45-1211/r.2025.04.007
发布时间
2025-09-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（No.82160389）
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