换一批不同产区厚朴 nrDNA ITS 序列分析及亲缘关系鉴定
NrDNA ITS sequences analysis and genetic rela‐tionship identification of Magnolia officinalis from different geographical regions
摘要以陕西、四川、浙江、重庆、福建、广西主产区的11个种源厚朴为材料,采用 PCR 直接测序法,测定不同产区厚朴的核糖体 DNA ITS 区序列,并结合 GeneBank 中相关植物的 ITS 序列(以同属近缘物种辛夷为外类群),应用 Kimura‐2遗传距离与 NJ 系统树分析法对不同产区厚朴的亲缘关系进行分析.结果表明:11个产区厚朴的 ITS 全序列长度介于593~600 bp ,其中,ITS1长度为214~217 bp ,G + C 含量为54.42%~55畅35%,ITS2长度为215~219 bp ,G + C 含量为59.82%~60.95%;ITS 序列共有36个变异位点,均出现在ITS1(7个)和 ITS2(29个)序列中,虽然位点变异与部分叶形变化出现吻合,但无必然联系;序列间遗传分化距离为0.000~0.02792,11个产区厚朴构成3个分支,显示出产区间厚朴的亲缘关系,其中陕西洋县(SXYX)、陕西西乡(SXXX )、福建武夷山(FJWYS)及四川彭州(SCPZ)四个产区 ITS 序列完全一致. nrDNA ITS 序列分析可作为厚朴不同产区亲缘关系鉴定的手段.
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关键词
nrDNA ITS 序列厚朴系统聚类亲缘关系nrDNA ITS sequencesMagnolia of f icinalishierarchical clusteringgenetic relationship
发布时间
2013-04-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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