西南地区野生狗牙根种质资源的SSR 与 AFLP 联合分析

Joint analysis of SSR and AFLP on wild Cynodon dactylon germplasm of southwest China

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摘要为了制定科学的资源保护策略、促进其开发利用以及新品种的选育，对西南地区55份野生狗牙根材料，联合采用 SSR 和 AFLP 方法分析其遗传多样性.通过进行引物筛选，筛选出有效引物组合18对和11对；SSR 和 AFLP 扩增总条带353和626条，多态性条带267和592条，平均每对引物扩增出多态性条带19．61和53．83条，多态性位点百分率为75．10％和94．57％.聚类分析表明 GS＝0．806时，可将所有供试材料分成6个组群，当 GS＝0．82时，可将第 VI 个组群分成4个小组，当 GS＝0．836时，第 VI 组群中第3小组的14个材料分为3个组群基于 Shannon 多样性指数，类群内的遗传变异占总变异的67．41％，类群间的遗传变异占总变异的32．59％.基于 Nei 氏无偏估计的遗传一致度的聚类分析表明，各生态地理类群间的遗传分化与其所处的生态地理环境具有一定的相关性.通过两种标记的相关性分析，表明 SSR 和 AFLP 标记之间具有显著的相关性，而且相关性较高，证明供试材料的聚类和其生态地理环境间有一定的相关性；采用 SSR 和 AFLP 两种联合分析，结果会更加合理和有效.