橡胶树橡胶生物合成调控相关基因的表达相关性分析

Correlation analysis on expression of genes related to rubber biosynthesis regulation of rubber tree

二维码有效期 120s

摘要该文通过qPCR获得了正常割胶条件下,9个茉莉酸信号途径关键环节基因HbCOI1、HbJAZ1、HbJAZ2、HbJAZ3、HbMYC1、HbMYC2、HbMYC3、HbMYC4、HbMYC5和6个橡胶生物合成相关基因HbHRT2、HbSRPP、HbREF、HbHMGR1、HbHRT1、HbGAPDH在5个橡胶树魏克汉种质和5个1981'IRRDB种质胶乳中的表达数据;通过皮尔逊相关系数分析了这15个基因彼此间的表达相关性,分别获得105对基因的双变量相关系数(r12)和偏相关系数(r12.3),所有105对基因的双变量相关系数(︱r12︱)和偏相关系数(︱r12.3︱)的平均值分别为0.486±0.220和0.304±0.211,达到0.05的差异显著水平.其中,r12与r12.3方向相同的63对(60％),方向相反的42对(40％);︱r12︱<︱r12.3︱的23对(21.905％),︱r12︱>︱r12.3︱的82对(78.095％);双变量相关显著性P<0.05的76对(72.38％),P<0.01的59对(56.19％);偏相关显著性P<0.05的21对(20％),P<0.01的16对(15.24％).结果显示,这两条途径中的基因表达彼此相关,这为基因表达谱分析中普遍采用的前提假设"功能相关基因的表达相关"提供了进一步的实验证据,可用于挖掘、筛选和预测与橡胶生物合成相关的未知基因,为研究橡胶树产量形成的分子调控机理提供理论基础.

作者杨署光 ^[1] 杨秀光 ^[2] 赵悦 ^[3] 史敏晶 ^[1] 李言 ^[1] 邓小敏 ^[1] 晁金泉 ^[1] 田维敏 ^[1] 学术成果认领

作者单位中国热带农业科学院橡胶研究所、农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室、省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室,海南儋州 571737 ^[1] 云南省临沧市沧源佤族自治县勐角民族乡农业综合服务中心,云南临沧 677401 ^[2] 中国农业大学农学院,北京 100193 ^[3]

关键词巴西橡胶树割胶茉莉酸信号途径橡胶生物合成基因表达 Pearson相关

分类号 Q943.2

栏目名称

生理与分子生物学

DOI 10.11931/guihaia.gxzw201903021

发布时间 2021-01-18

基金项目

国家重点研发计划项目（2018YFD1000502）；国家青年科学基金（31800578,31700601,31800577）；国家天然橡胶产业技术体系分子育种岗位专项项目（CARS-34-GW1）