换一批白花刺续断野生居群的叶绿体全基因组特征解析
Analysis of complete chloroplast genome characteristics from wild populations of Acanthocalyx alba
摘要白花刺续断在中国西藏是一种常用的药用植物,但其叶绿体全基因组的相关研究较少.为揭示该物种叶绿体全基因组的基本特征并探讨其谱系遗传结构,该研究利用Illumina测序平台对来自5个野生居群的10个白花刺续断个体进行二代测序,经组装、注释,得到10条完整的叶绿体全基因组序列,并对它们的基因组特征和居群间的谱系进化关系进行了初步研究.结果表明:(1)白花刺续断的叶绿体全基因组大小为155335～156266 bp,共注释113个基因,包括72个蛋白编码基因、30个tRNA基因和4个rRNA基因,其叶绿体基因组的大小、结构、GC含量及基因组成等方面在种内高度保守.(2)基因组比较分析表明,白花刺续断变异较大的片段均位于单拷贝区,且IR边界未出现明显的扩张和收缩.(3)群体遗传分析发现,白花刺续断的野生居群具有明显的地理遗传结构,不同居群间在遗传距离与地理距离上具有一定的相关性.研究认为,白花刺续断叶绿体基因组在种内居群水平上比较保守,且叶绿体基因组可在居群水平上揭示物种的地理遗传结构.这为后续开展刺续断属物种群体遗传学和系统发育基因组学研究奠定了基础.
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分类号
Q943
栏目名称
DOI
10.11931/guihaia.gxzw202106057
发布时间
2022-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（32060091）；
云南省中青年学术（202105AC160063）；
技术带头人后备人才项目（ZKLX2019318）；
大理大学中药资源与民族药创新团队项目（202005AF150013）；
云南省李剑专家工作站
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